拡散の解析 - Ryohei’s neuroscience notes

週末に考えていた簡単Rasの拡散＆不活性モデルで実験結果をfittingさせるプログラムを作る。最近、デンドライトでのRasの活性の広がりを捕らえることができたので、それがRasの拡散によるものかをモデルを作って調べたいわけだ。簡単に、デンドライトはただの棒ということにして、１次元拡散でいいことにする。そんで、拡散方程式に、Rasの不活性項を加えただけのもので近似する。はてなダイアリーにはせっかくＴｅｘ機能があるから、数式も書いておくか。

$\frac{\partial \phi}{\partial t} = D \frac{\partial^2 \phi}{\partial t^2} - k_{-}\phi$

あとは、実験でやっている境界条件をいれれて解くのみ。フィッティングで使うパラメーターは、たった３つ。しょうもないバグをとりつつ、ようやく動くようになったところで、今日は終了。間違っていないか不安だから、あとでスリに見てもらおうかな。。。。

明日はGreen card用健康診断だから、そちらの準備のほうをすることにする。I-693をプリントアウト。グーグル地図で場所確認などなど。車で２時間の長旅になる予定。